Identificación de variación clonal funcional en Tempranillo y Garnacha mediante el uso de ensamblajes de genomas de referencia varietales
- Pablo Carbonell Bejerano
- Carolina Royo Brun
- Y. Ferradás
- Maite Rodríguez Lorenzo
- Noelia Alañón Sánchez
- I. Bezrukov 1
- C. Lanz 1
- Javier Ibáñez Marcos
- D. Weigel 2
- 1 Max-Planck-Institute for Biology
- 2 Max-Planck-Institute for Biology, Germany
- Gonzaga Santesteban (coord.)
- Nazareth Torres (coord.)
Editorial: SECH (Sociedad Española de Ciencias Hortícolas)
ISBN: 978-84-09-38456-3
Año de publicación: 2022
Páginas: 13-16
Congreso: Jornadas del Grupo de Viticultura y Enología de la SECH (4. 2022. Pamplona)
Tipo: Aportación congreso
Resumen
Las variedades de vid (Vitis vinifera L.) se caracterizan por su alta heterocigosidad(variación entre sus copias genómicas de herencia materna y paterna), lo que obliga a lapropagación vegetativa como única vía posible para reproducir su genotipo y sus característicasvarietales. Sin embargo, la propagación vegetativa prolongada da lugar a la acumulación demutaciones somáticas que en ocasiones pueden producir fenotipos de interés que son la basepara la mejora mediante selección clonal. En este trabajo hemos producido ensamblajes de losgenomas de Tempranillo y Garnacha. Usando los ensamblajes como referencia, pudimosidentificar variación genómica responsable de caracteres de interés en clones o variantessomáticas seleccionadas de cada variedad. En Tempranillo se identificó una deleción de grantamaño en un clon con color de baya más oscuro de lo normal, relacionada con una reducciónen la acumulación de ceras en la cutícula de la baya. En Garnacha se identificaron dos patronesde deleción distintos que causan la pérdida de los genes MYB necesarios para la síntesis deantocianinas en el hollejo, que suponen dos orígenes independientes de la variedad GarnachaBlanca. Estos resultados muestran como el ensamblaje de genoma puede ayudar a conocer elorigen de las características varietales y posibilitar la trazabilidad de variación genética clonalútil para la innovación intravarietal.