Caracterización molecular del banco de germoplasma de vid del Rancho de la Merced

Resumen

La vid (Vitis vinifera L.) es una especie que presenta una gran diversidad genética que se conserva fundamentalmente en bancos de germoplasma. Sin embargo, la identificación genotípica de las accesiones puede reducir bastante el número de variedades distintas, debido a la gran abundancia de sinonimias y homonimias que existe entre el material vegetal conservado. Tradicionalmente la caracterización de las variedades de vid se ha basado en la descripción morfológica de las plantas. La ampelografía presenta una serie de limitaciones, que le sitúan en desventaja frente a otras técnicas de reciente desarrollo. Una de las más importantes es el tiempo que se requiere para realizar la descripción completa de una variedad, ya que la planta debe ser adulta, lo que se puede traducir en cuatro años desde que se inicia la plantación, y además porque hay que describir caracteres que abarcan un ciclo vegetativo completo de la planta y, como se ha comentado, las descripciones deben realizarse durante al menos dos años. Otras limitaciones de la ampelografía están relacionadas con la dificultad para obtener descriptores universales debido a la variabilidad con que se manifiestan ciertos caracteres en distintos ambientes (clima, suelo, etc.) y también a la subjetividad que introduce el propio descriptor. Una alternativa al uso de marcadores morfológicos son los marcadores moleculares. En concreto, los marcadores moleculares denominados microsatélites o SSRs son los de mayor diversidad y fiabilidad para la identificación de variedades y portainjertos de vid. Los microsatélites son regiones de la secuencia de ADN que presentan repeticiones simples de 2, 3 ó 4 nucleótidos. El número de repeticiones de cada una de estas secuencias simples puede variar en distintos individuos de una especie y es un carácter heredable. El IFAPA en su Centro Rancho de la Merced, conserva una de las colecciones de vid más importantes de Europa. Las colecciones tienen como fin la conservación de la máxima diversidad genética posible, su caracterización y su puesta a disposición de los investigadores o productores que lo soliciten. El objetivo general de esta tesis es ¿La caracterización molecular del banco de germoplasma de vid del Rancho de la Merced¿, con el fin de contribuir a la gestión y conservación eficaz de sus variedades. Para ello se han caracterizado un total de 702 accesiones de vid conservadas en este banco con marcadores moleculares tipo microsatélites lo que ha permitido identificar 405 genotipos no redundantes. Este análisis ha permitido además identificar 35 posibles nuevas sinonimias, 11 posibles variantes somáticas y 4 homonimias. Además se ha detectado un 11,4% de errores de denominación dentro de la colección. Por otro lado, el análisis genético de variedades recolectadas en Andalucía ha permitido aclarar la identidad del 81,6% de las variedades y recuperar nueve variedades en riesgo de extinción, no conservadas hasta ahora en bancos de germoplasma. Por último, se han identificado relaciones de parentesco entre los genotipos no redundantes incluidos en la colección. Ello ha permitido confirmar 59 pedigríes varietales descritos en la literatura y determinar 24 nuevos.